Фамилия Киселис — один из тех случаев, когда окончание сразу выдаёт неславянское происхождение. В русском языке типичные фамильные суффиксы — -ов, -ев, -ин, -ский. Форма на -ис здесь указывает на латышские или, реже, литовские корни. В латышском языке суффикс -s — это стандартное окончание мужского рода в именительном падеже, а основа фамилии — это переоформленное славянское прозвище или имя.

Основа здесь — «Кисел-». Скорее всего, это вариант фамилии Кисель, распространённой у белорусов, украинцев и поляков. В старину «кисель» было не только названием блюда, но и прозвищем. Киселём могли назвать вялого, медлительного или чересчур мягкого человека. Встречалось это прозвище и как уменьшительное от имени Кирилл или Кис (древнерусское нецерковное имя). Когда носитель такого прозвища оказывался на территории современной Латвии (особенно в Латгалии, где исторически сильны славянские и польские влияния), его фамилию адаптировали по местным грамматическим правилам: прибавили латышское окончание -is. Так Кисель превратился в Киселиса.

Вторая, менее вероятная версия — что фамилия образована напрямую от латышского слова «kiselis» (кисель, как напиток из ягод), но это слово само является заимствованием из славянских языков, так что круг замыкается. Правдоподобнее считать, что предки носителя фамилии Киселис — это православные или католики из восточных регионов Латвии, чью славянскую фамилию в XIX веке, при паспортизации, записали по-латышски. В отличие от чисто русских фамилий, у Киселис нет сословной привязки: так могли оформить и крестьянина, и мещанина.