Фамилия Клунова — женская форма, а её мужской вариант Клунов. В основе фамилии лежит нецерковное имя или прозвище Клун. Слово «клун» в русских говорах имело несколько значений, и чтобы понять, от какого именно пошла фамилия, нужно разобраться в географии и контексте.

Самое вероятное объяснение — прозвище от глагола «клунить» или «клуниться». В южнорусских и украинских говорах «клунитися» означало «гнуться, сгибаться, горбиться». Клуном могли назвать сутулого, сгорбленного человека. В этом случае фамилия — типичный пример прозвища по внешнему признаку, которое закрепилось за родом. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Клуна» или «из семьи Клуна».

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая место: «клун» — это диалектное название амбара или клети для хранения сена (от «клуня»). Однако прозвище по названию постройки встречается реже, чем по внешности или характеру. Если бы предок жил рядом с клуней или работал в ней, фамилия скорее имела бы суффикс -ин (Клунин) или -ский (Клунский). Поэтому версия с сутулостью выглядит убедительнее.

Фамилия Клунов встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине. В старых документах её фиксируют с XVII века: например, в переписных книгах Курского края упоминаются крестьяне Клуновы. Это крестьянская или посадская фамилия — дворянских родов с такой основой не зафиксировано.

Интересная деталь: однокоренные фамилии Клунин, Клунников, Клунский — все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами. Клунова стоит в ряду самых простых по образованию: основа + -ов, без дополнительных приращений. Это говорит о том, что фамилия сложилась в среде, где прозвище было очевидным и не требовало уточнения через профессию или место жительства.