Фамилия Клышкин — это типичная русская фамилия, образованная по модели «прозвище + суффикс -ин». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Клышкин буквально означает «сын Клышки» или «потомок Клышки». Само прозвище Клышка — это короткое, ёмкое слово, которое могло возникнуть в разных говорах и ситуациях, поэтому у фамилии несколько версий происхождения.

Самая прямая версия — от слова «клык». Клышкой могли прозвать человека с заметными, выдающимися зубами. Но в переносном смысле «клыкастый» на Руси означало не только внешность, но и характер: острого на язык, язвительного, ехидного болтуна. Такое прозвище давали тому, кто умел «вцепиться» словом.

Совсем иное значение встречаем в тверских и псковских говорах. Там бытовал глагол «клыкать» — плакать, хныкать, капризничать. В этом случае Клышка — это плакса, слабохарактерный или обидчивый человек. Прозвище могло закрепиться за ребёнком или взрослым с такой манерой поведения.

Есть и «женский след» в происхождении. В центральнорусских говорах словом «клыка» или «клычка» называли наседку, курицу с цыплятами. Отсюда — переносное значение: суетливая, чрезмерно заботливая женщина, которая «кудахчет» над детьми. В этом случае прозвище Клышка могла получить хозяйка, а фамилия Клышкин перешла уже по мужской линии от её прозвища.

Наконец, не стоит сбрасывать со счетов «питейную» версию. В некоторых регионах «клыгой» называли брагу или пиво. Тогда Клышка — это либо любитель выпить, либо, что не менее вероятно, торговец хмельными напитками или даже винодел. Такая версия объясняет фамилию через ремесло или привычку предка.

Какая из версий верна для конкретной семьи Клышкиных — без генеалогического исследования сказать трудно. Но все они показывают, что прозвище Клышка было распространено в разных слоях и регионах, а фамилия Клышкин — не единичная, а вполне характерная для русского ономастикона.