Фамилия Кобылис звучит непривычно для русского уха, но её происхождение — чисто славянское, с литовским или польским оттенком. В основе лежит слово «кобыла» — самка лошади. Такое прозвище на Руси давали не для оскорбления, а по характерному признаку: высокому росту, долговязости, крупной фигуре или, напротив, по работе с лошадьми. Однако ключевая особенность фамилии — не корень, а суффикс «-ис».

Это окончание указывает на географию. В русском языке фамилии на «-ис» — редкость; они характерны для литовской и польской ономастики (ср. Балтрушайтис, Садаускис, или польские формы типа Кобылис как вариант Кобыльского). Скорее всего, носитель фамилии жил на землях бывшего Великого княжества Литовского — в нынешней Беларуси, Литве или восточной Польше. Там прозвище «Кобыла» получило местный суффикс, который закрепился в документах. В русских переписях такая фамилия почти не встречается — она осела в западнорусских говорах и метриках католических костёлов.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от имени собственного Кобыл или Кобылис как уменьшительной формы древнепрусского или литовского имени, связанного с конём (например, от *kumelys — жеребёнок). Но она не подтверждена массовыми данными. Правдоподобнее, что перед нами — типичное прозвищное образование, где суффикс «-ис» играет роль притяжательного или патронимического показателя, как в литовских фамилиях на «-итис».

По сословию предки Кобылисов могли быть крестьянами или мелкими шляхтичами — в Литве и Беларуси прозвища на «-ис» носили как простолюдины, так и обедневшие дворяне. Точных сведений о дворянских гербах нет, но в польских гербовниках встречается род Кобыльских, от которого Кобылисы могли ответвиться через диалектное произношение.

Таким образом, фамилия Кобылис — не русская в классическом понимании, а восточнославянская с балтийским следом. Она прямо указывает на предка по прозвищу Кобыла, жившего на западе исторической Руси.