Фамилия Кобылкин образована от прозвища Кобылка. Такое прозвище человек мог получить за свою работоспособность (известно выражение «работать как лошадь») или, напротив, за леность. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кобылка, со временем получил фамилию Кобылкин.