Фамилия Когуут — редкий случай, когда написание подсказывает произношение, а произношение — происхождение. Двойное «у» в середине слова неслучайно: это не опечатка и не вариант фамилии Когут, а указание на долгий, ударный звук [у:]. В украинских и южнорусских говорах такое удвоение на письме встречается, чтобы передать оканье или, наоборот, сильное уканье. Но главное здесь — основа.

В основе лежит слово «когут», что в украинском, польском, чешском и словацком языках означает «петух». Фамилия Когут широко распространена у украинцев, поляков, чехов и словаков. Форма Когуут, скорее всего, возникла в результате народной этимологии или фиксации местного произношения: когда носитель фамилии произносил её с долгим ударным «у», переписчик или чиновник записывал это двойной буквой. Это не суффиксальная модель, а чисто фонетический вариант. Суффикса в фамилии нет — перед нами чистая основа, прозвище, ставшее фамилией.

Прозвище Петух (Когут) давали людям с яркой внешностью, громким голосом, задиристым характером или любовью к раннему подъёму. В славянской ономастике это типичный пример прозвища по сходству с животным. Б. Унбегаун в «Русских фамилиях» относит Когут к группе фамилий, образованных от названий птиц, и отмечает их западно- и южнорусское происхождение.

Географически фамилия Когуут, в отличие от обычного Когут, встречается редко и привязана к регионам, где украинское влияние смешивалось с русским — Курская, Белгородская, Воронежская области, а также юг Украины. Встречается она и в среде казачества, где прозвища были особенно образными.

Таким образом, Когуут — это не отдельная фамилия с особым смыслом, а фонетический дублет фамилии Когут, закреплённый в документах. Носитель такой фамилии может считать, что его предки происходят из мест, где говорили с заметным уканьем, и, скорее всего, были людьми заметными — голосистыми или вспыльчивыми, как петухи.