Фамилия Коханенко — характерный пример украинской модели фамилий, образованных с помощью суффикса -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в восточнославянской ономастике, особенно в Украине, изначально имел значение «сын» или «потомок». Таким образом, Коханенко — это буквально «сын Кохана» или «потомок Кохана». В XVII–XVIII веках фамилии на -енко стали массово закрепляться за казацкой старшиной и крестьянами, вытесняя более древние формы именования.

В основе фамилии лежит прозвище Кохан. Оно напрямую связано с украинским прилагательным «коханний» — «любимый, милый». Прозвище Кохан давали дорогому, близкому, любимому человеку, возможно, младшему сыну или внуку, которого особенно ласкали. Интересно, что слово «кохан» бытовало не только в украинских землях, но и в курско-орловских говорах на юге России, что указывает на древние диалектные связи.

В отличие от многих прозвищ, образованных от профессий или внешних черт, Кохан относится к группе так называемых «ласкательных» прозвищ. Такие имена нередко давались не в насмешку, а как постоянное семейное или домашнее имя, которое со временем вытеснило крестильное. Коханенко — фамилия, которая прямо говорит о тёплом отношении к предку, а не о его ремесле или социальном статусе.

В документах фамилия встречается с разными вариантами написания: Коханенко, Коханенков, а также Коханов (без суффикса -енко). Последний вариант чаще встречается в русской среде, где прозвище Кохан адаптировали по модели -ов. Однако именно форма Коханенко осталась самой распространённой и указывает на украинские корни рода.

Если говорить о географии, то фамилия Коханенко сегодня чаще всего встречается в центральных и восточных областях Украины (Полтавская, Черкасская, Днепропетровская), а также среди потомков переселенцев на Кубани. В России она менее распространена, но фиксируется в южных регионах, куда в XVIII–XIX веках активно мигрировали украинские крестьяне и казаки.