Фамилия Коханый образована напрямую от прозвища. В его основе лежит украинское прилагательное «коханный» — «любимый, милый». Таким прозвищем в семье или в кругу близких могли называть дорогого человека, возможно, позднего или единственного ребенка, либо мужа. Встречается и другая, бытовая версия: прозвище Коханый мог получить человек, который часто употреблял это ласковое обращение в речи.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: фамилия представляет собой субстантивированное прилагательное, то есть перешедшее в разряд существительных без дополнительных суффиксов (-ов, -ин). Это характерно для украинской ономастики, где фамилии на -ый встречаются реже, чем на -енко или -ук, но устойчиво бытуют в западных и центральных областях Украины. Мужской род окончания указывает, что фамилия закрепилась за главой рода.

С точки зрения лингвистической географии, фамилия Коханый — почти исключительно украинская. В русских говорах прилагательное «коханый» не употреблялось, а в польском языке «kochany» имеет то же значение, но польские фамилии чаще оформлялись суффиксами -ski/-cki. Поэтому украинское происхождение фамилии наиболее вероятно. В дореволюционных метриках и ревизских сказках такая форма встречается редко, что говорит о её локальном бытовании — скорее всего, на Правобережье или в Слобожанщине.

Иногда фамилию Коханый путают с однокоренной Коханов или Кохановский. Разница в том, что Коханов — это уже притяжательная форма («чей?» — Коханов), а Коханый — прямое прозвище. Фамилия не имеет отношения к польскому шляхетскому роду Кохановских — те происходят от топонима Коханов. Таким образом, фамилия Коханый — это не аристократический, а народный, «домашний» вариант, сохранивший тепло исходного слова.