Фамилия Кокоринова — женская форма фамилии Кокоринов. Её основа — прозвище или мирское имя Кокоря, которое в русских говорах имело несколько значений. В словаре Владимира Даля «кокоря» — это коряга, кривое дерево, а также человек с изъяном, неуклюжий или упрямый. В северных и сибирских диалектах кокорей называли скупого, прижимистого человека. В ономастике слово «кокоря» известно с XV века: в новгородских писцовых книгах встречаются крестьяне с таким прозвищем, что говорит о древности корня.

Суффикс -ов- в фамилии Кокоринов указывает на типичную русскую модель образования от прозвищ на -я: сначала появилось притяжательное прилагательное «Кокоринов сын» (то есть сын Кокори), которое затем закрепилось как фамилия. В отличие от фамилий на -ин, которые образуются от основ на -а/-я, здесь суффикс -ов- присоединяется к основе Кокор- через интерфикс -ин-, что встречается реже: обычно от прозвищ на -я (Кокоря) образуют фамилию Кокорин, а вариант Кокоринов — вторичный, возникший, возможно, под влиянием фамилий на -инов (как Мининов от Минин).

Географически фамилия Кокоринов (и её женская форма) тяготеет к северным и центральным областям России: Архангельской, Вологодской, Костромской губерниям. Там слово «кокоря» было особенно употребительно. В Сибири, куда переселялись поморы, фамилия тоже встречается, но реже.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с диалектным «кокорить» — говорить свысока, важничать. Если так, то прозвище Кокоря могло получить человек с завышенной самооценкой. Однако первое значение — «коряга» или «упрямец» — подкреплено более ранними письменными источниками.

Сословная принадлежность носителей фамилии неоднородна. В XVIII веке Кокориновы фиксируются как крестьяне и посадские люди, но есть и исключение: Иван Кокоринов (1725–1761) — архитектор, первый директор Императорской Академии художеств. Он происходил из обер-офицерских детей, что говорит о том, что фамилия не была закреплена за одним сословием.