Фамилия Командакова почти наверняка происходит не от глагола «командовать», а от названия конкретного места. В основе лежит топоним Камандак — деревня бывшего Симбирского уезда Симбирской губернии (позднее территория Майнского района). Сегодня этого населённого пункта уже нет.

О времени возникновения деревни известно немного, но есть документальное подтверждение: в 1739 году уже существовала «солдатская слобода Камандак». Скорее всего, поселение основали в первой половине XVIII века, и его жители — служилые люди, солдаты. Фамилию Командакова получил тот, кто был выходцем из этой слободы или деревни. Такая модель образования фамилий от названия местности (по принципу «откуда родом») типична для центральных и поволжских губерний России.

Версия о связи с командованием маловероятна: прозвище Командак для военачальника или властного человека встречалось бы, но следов такого прозвища в исторических источниках по Симбирскому краю нет. Географическая привязка выглядит гораздо надёжнее.