Фамилия Кондрацков — редкий случай, когда суффикс выдает географию точнее, чем корень. Основа — крестильное имя Кондрат (от латинского Кондратий, «четвероногий»? нет, это народная этимология; на деле Кондратий из латинского quattuor — «четвертый»). Но если бы фамилия была образована стандартно, от имени Кондрат, мы бы получили Кондратов. Вместо этого — Кондрацков, с суффиксом -цк-, который в русских фамилиях почти всегда указывает на польское или украинское происхождение.

В польской ономастике суффикс -цк- (-cki) типичен для шляхетских фамилий, образованных от названий поместий. Кондрацкий — типичная польская фамилия, означающая «владелец Кондратова» или «выходец из Кондратова». При переходе в русскую среду фамилию русифицировали, добавив типичный русский патронимический суффикс -ов. Так Кондрацкий превратился в Кондрацкова — «сын Кондрацкого». Вторая версия: фамилия могла возникнуть прямо на русской почве, но от прозвища Кондрац, которое давали выходцу из Польши или Малороссии. В любом случае, носитель фамилии Кондрацков с высокой вероятностью имеет предка, который либо носил фамилию Кондрацкий, либо получил прозвище по месту жительства в пограничных областях.

Географически фамилия тяготеет к югу России и бывшим казачьим областям: встречается в Ростовской области, Краснодарском крае, на Украине. Сословно предки Кондрацковых, скорее всего, были не крестьянами и не дворянами, а однодворцами или казаками — людьми, которые несли службу на границе и часто имели польские корни по отцу или деду. В XIX веке фамилия фиксируется в документах Воронежской и Курской губерний. Редкость фамилии (всего несколько сотен носителей в России) говорит о том, что она не прошла массовую унификацию и сохранила свой изначальный, локальный ареал.