Фамилия Кононцов образована от имени собственного и относится к распространенному типу славянских фамилий. Основой фамилии Кононцов послужило церковное имя Конон. Имя Конон, очень распространенное в старину, имеет греческое происхождение и переводится как «трудящийся, трудолюбивый». Фамилия Кононцов представляет собой отчество второго порядка: Кононцов — сын Кононца, внук Конона. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Конон, со временем получил фамилию Кононцов. О точном месте и времени возникновения фамилии Кононцов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Кононцов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.