Фамилия Коняткины образована от прозвища Конятка. В основе лежит украинское слово «конятка» — уменьшительное от «конь». Прозвище могло указывать на род занятий: уход за лошадьми, работа конюхом. Но есть и другая версия: в некоторых говорах так называли конский щавель — растение, которое шло в корм скоту или использовалось в народной медицине. В этом случае прозвище мог получить травник, знахарь или просто человек, живший в местности, где этот щавель был особенно распространён.

Модель образования фамилии типична для восточнославянской ономастики: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «сын Конятки». Такая патронимическая форма чаще встречалась в северных и центральных землях России, где суффикс -ин вытеснял южный -ов. Интересно, что украинская основа при русском суффиксе — не редкость для пограничных территорий, например, бывшей Слобожанщины или южных уездов Рязанской губернии.

Однокоренные фамилии — Конятов, Конятников, Коняшкин — встречаются редко, что делает Коняткиных заметным исключением. В дореволюционных источниках фамилия фиксируется в основном в крестьянской среде, без привязки к дворянским родам. О точном месте и времени возникновения говорить сложно: процесс формирования фамилий растянулся на несколько столетий, и письменные свидетельства по этой фамилии единичны.