Фамилия Копарулин — редкий пример, где суффикс -ин скрывает не отчество, а прозвище по занятию. В русской модели -ин обычно присоединяли к основам на -а/-я (Петя — Петин, Кузьма — Кузьмин). Но здесь основа «Копарул» — не имя, а искажённое или диалектное название профессии. Скорее всего, перед нами вариант прозвища Копарь или Копаруля, которое давали землекопу, копальщику колодцев, могильщику или тому, кто работал киркой в каменоломне. Суффикс -ул(я) придаёт слову разговорный, даже пренебрежительный оттенок (сравните: «копуша» или «растяпа»), но в прозвище он мог просто указывать на характерное действие — человека, постоянно копающего.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям, где слово «копаруля» (или «копарулька») в некоторых говорах означало лопату или заступ. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и однодворцы с фамилиями Копарев, Копарихин, Копарухин — все они восходят к одному корню. Копарулин, вероятно, возник как патроним от прозвища Копаруля: «чей? — Копарулин сын», то есть потомок человека, известного своим ремеслом.

Версия о происхождении от тюркского корня (например, от «копар» — «могила» или «копать») маловероятна: в русской антропонимии такие заимствования обычно давали фамилии на -ов, а не на -ин. Кроме того, форма «Копарул» нехарактерна для тюркских языков. Поэтому основная гипотеза — чисто русская, профессионально-прозвищная, с редким суффиксом -ул-, который и делает фамилию узнаваемой среди однокоренных.