Фамилия Копотун образована от аналогичного прозвища, которое восходит к диалектному слову «копотун» - так называют копотливого человека. Скорее всего, такое прозвище указывало на черты характера и поведение его обладателя. Вероятно, так прозвали медлительного, неповоротливого человека.