Фамилия Копытин — один из примеров того, как русская фамилия рождается не из имени, а из прозвища, связанного с бытом, внешностью или занятием человека. В её основе лежит слово «копыто». Проще всего предположить, что Копытом дразнили пастуха — человека, который постоянно имел дело с копытами скота. Но исторические записи подсказывают другую, более конкретную версию: прозвище Копыто часто давали хромому. Человек с такой походкой как бы «бил копытом» или ступал тяжело, с пристуком.

Прозвище это встречается в документах с XV века. Степан Веселовский в своих ономастических трудах упоминает сразу нескольких Копыт: Яков Копыто из Переяславля (середина XV века), крестьянин Михаил Копыто из Новгорода (1495 год), князь Юрий Михайлович Копыто Мезецкий (середина XVI века) и Василий Федорович Копыто Слизнев (1495 год). Последний пример особенно показателен: человек носил двойное прозвище, где Копыто — одна из его характеристик. То есть прозвище бытовало не только среди крестьян, но и в среде служилых людей и даже князей.

Фамилия образовалась по стандартной русской модели: к основе «Копыт-» добавили суффикс принадлежности «-ин». В древнерусском языке суффикс -ин означал «чей?», «сын кого?». Копытин — буквально «сын Копыты» или «человек из семьи Копыты». Такой тип фамилий (на -ин) характерен для севера и центра России, в отличие от южных фамилий на -ов.

Географически фамилия привязана к чернозёмным областям. В Книге памяти Республики Коми записан Копытин Алексей Егорович, 1874 года рождения, уроженец села Прудовое (бывшая Центрально-Чернозёмная область, ныне Воронежская). В Книге памяти Липецкой области отмечены Копытин Александр Семенович (1887 г. р.) из села Порой Лебедянского района и Копытин Василий Семенович (1876 г. р.) из деревни Малые Извалы (Воронежская область). Все три записи — из одного региона, что указывает на плотное бытование фамилии в южнорусских землях.

Словообразовательный разбор прост: корень «копыт» (от «копыто»), суффикс «-ин». Ударение в фамилии падает на второй слог: Копы́тин. Редких или спорных версий происхождения у этой фамилии нет — она прозрачна и не требует сложных этимологических реконструкций.