Фамилия Копытко образована от прозвища Копыто. В народе так могли называть человека с характерной походкой — возможно, прихрамывающего или того, кто ступал тяжело, с притопом, что напоминало цокот копыт. Есть и другая, более бытовая версия: прозвище Копыто закреплялось за пастухом, который постоянно имел дело с копытами скота — лечил, подрезал, подковывал. В этом случае прозвище указывало на ремесло, а не на внешность.

В словообразовательном плане фамилия выделяется уменьшительно-ласкательным суффиксом -к-, который в украинской, белорусской и южнорусской традиции часто присоединяли к основе прозвища, придавая ей более фамильярный или семейный оттенок. То есть Копытко — это не просто «сын Копыта», а скорее «маленькое Копыто» или «Копыто-младший». Такая модель особенно характерна для западнорусских и малороссийских земель.

Позже прозвище Копыто, изначально бытовавшее как дополнительное именование, полностью заменило наследственное имя в повседневной жизни и официальных документах. Фамилия Копытко нечастая, её география тяготеет к западным областям России и востоку Украины, где суффикс -ко встречается массово. Встречаются и однокоренные варианты — Копытов, Копытин, Копытько, но Копытко стоит особняком именно за счёт мягкого, уменьшительного окончания, которое смягчает исходное прозвище.