Фамилия Корчунов образована от прозвища Корчун. В его основе, скорее всего, лежит глагол «корчить» — «гнуть, перегибать, мять, сводить судорогами» или «передразнивать». Такое прозвище могло указывать на особенности внешности (например, скрюченная фигура) или на манеру поведения — на любителя покривляться. Вторая версия, не менее правдоподобная, связывает прозвище с глаголом «корчевать». В этом случае Корчуном называли человека, занятого тяжёлым трудом по выкорчёвке пней и расчистке земли под пашню. Такая работа была распространена в лесных регионах России, и прозвище относилось к числу «профессиональных» — указывало на род деятельности, а не на характер.

Менее вероятно, хотя и не исключено, что прозвище восходит к монгольскому слову «корчи» — «стрелок». Если принять эту гипотезу, основатель рода мог быть связан с военным делом, но она уступает первым двум по убедительности: славянская основа «корч-» даёт более естественное и прямое объяснение.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ, оканчивающихся на твёрдый согласный: Корчун → Корчунов, то есть «сын Корчуна». Фамилия не относится к числу дворянских или книжных — она возникла в крестьянской или посадской среде, где прозвища с точностью выделяли человека среди соседей. Интересно, что фамилия встречается в основном в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает версию о связи с земледельческим трудом — корчеванием.