Фамилия Кордун — одна из тех, где исследователи предлагают несколько версий, и единого мнения нет. Самая прямолинейная гипотеза связывает её с коневодством: от слова «корда» — длинная верёвка, на которой гоняют лошадей по кругу во время выездки. Прозвище Корда мог получить конюх или берейтор, работавший с лошадьми. Это слово пришло из французского (corde — верёвка) и закрепилось в русском языке именно как профессиональный термин.

Вторая версия уводит в этнографию Сибири. Исходным словом могло быть «кордавун» — так эвенки называли щипковый музыкальный инструмент. Если предок носил такое прозвище, он мог быть музыкантом или мастером по изготовлению инструментов, но эта гипотеза остаётся самой экзотической и редкой.

Третья группа версий рассматривает Кордун как искажённый вариант фамилий Корсун или Корзун. Здесь начинается путаница в говорах. Слово «корсун» в иркутских говорах означало лепёшку из толчёной черёмухи, то есть черёмуховую пастилу. Прозвище Корсун могли дать либо тому, кто хорошо её готовил, либо, по ассоциации с мягкостью продукта, человеку податливому и уступчивому. С другой стороны, «корза» в диалектах — это и сварливый, неуживчивый человек, и перекат на реке. Здесь фамилия могла указывать либо на тяжёлый характер, либо на место жительства предка возле речного переката. И наконец, в некоторых говорах Корзуном называли человека с выбитым передним зубом.

Какой из этих путей верный для конкретной семьи Кордунов, без генеалогического исследования сказать сложно. Но географически логичнее всего выглядит связь с южнорусскими и украинскими говорами, где «корда» и «кордава» были в ходу, а также с сибирскими диалектами, где зафиксированы «корсун» и «корза».