Фамилия Короткие — это родовое именование, которое закрепилось за потомками человека по прозвищу Короткий. Сама фамилия стоит в форме множественного числа и отвечает на вопрос «чьи?» (Короткие), что характерно для северных и центральных областей России, а также для Сибири. Такая модель образования фамилий (на -их, -ых) означает принадлежность целому роду или семье: «из дома Коротких».

Прозвище Короткий в основе фамилии имеет вполне прозрачную этимологию. Чаще всего так называли человека невысокого роста. Однако не стоит исключать и переносные значения: в говорах «коротким» могли назвать нетерпеливого, вспыльчивого человека («короткий на расправу») или того, кто говорил мало и ёмко. В старину прозвища, связанные с физическими качествами, были одними из самых распространённых.

Исторические источники сохранили немало родственных прозвищ и фамилий. В труде С. Б. Веселовского «Ономастикон» упоминаются: Коротень Васильевич Путилов (1490 год), а также Василий, Матвей, Кушник и Третьяк Коротневы, казнённые в опричнине в 1570 году. Любопытно и составное прозвище Короткие Ноги, которое носил Семен Давидович Данилов (вторая половина XV века). Эти примеры показывают, что корень «корот-» активно использовался в древнерусской антропонимии.

Фамилия Короткие — не единственная в этом ряду. Однокоренные фамилии (Коротков, Коротнев, Коротенький) различаются суффиксами, которые указывают на разную географию и время возникновения. Форма на -их/-ых, как у Коротких, считается более архаичной и часто указывает на то, что род происходит из северорусских земель или из среды казачества.