Фамилия Короткунов построена по простой и распространённой модели: к основе Короткун- добавили типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»). Значит, в основе лежит личное или прозвищное имя Короткун.

Сразу возникает вопрос: что означало это имя? Здесь есть две основные версии, и обе имеют право на существование.

Первая — самая прозрачная: Короткун образовано от прилагательного «короткий». Прозвище могло указывать на невысокий рост человека или на какую-то особенность его одежды, речи, характера. В русских говорах слово «короткий» имело и переносные значения — вспыльчивый, нетерпеливый. Так что прозвище могло быть и не про рост.

Вторая версия уводит в область народных верований. Имя Короткун, по мнению некоторых исследователей, связано с Корочуном — в славянской мифологии злым духом, олицетворяющим зимнее солнцестояние и смерть. Звучит мрачно, но в крестьянской среде существовал обычай давать детям «плохие» имена-обереги: считалось, что злые силы не тронут того, кого уже назвали в честь них или назвали «некрасиво». Надеясь вырастить здорового и красивого мальчика, родители могли наречь его Короткуном, чтобы обмануть нечистую силу. Эта практика была широко распространена на Руси, особенно в северных и сибирских регионах.

Какая из версий вероятнее? Прямое значение от «короткий» встречается чаще и не требует привлечения мифологии. Но вариант с обережным именем тоже реалистичен, особенно если фамилия исторически закрепилась в местностях, где культ Корочуна был силён. Оба объяснения рабочие, и выбор зависит от конкретной семейной истории.

Со временем прозвище Короткун закрепилось как основное именование человека, а его дети и внуки стали писаться Короткуновыми. Фамилия недвусмысленно говорит о том, что родоначальник нёс это прозвище, и теперь она — один из немногих следов, оставшихся от того давнего имени или народного поверья.