Фамилия Кошкарин образована от прозвища или имени Кошкара, а не напрямую от слова «кошка», как может показаться на первый взгляд. В основе лежит тюркское имя Кошкар (варианты — Кошкара, Кошкарбай), распространенное у татар, башкир и других народов Поволжья. Оно восходит к тюркскому «кошкар» — «баран-производитель», «вожак отары». В переносном смысле такое имя давали мальчикам как пожелание силы, выносливости и лидерских качеств. Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Кошкарин, то есть сын или потомок Кошкары.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «кошкарь» (или «кошкар»). В некоторых русских говорах так называли человека, который занимался ловлей кошек ради меха, или же просто кошатника. Однако эта гипотеза слабее, потому что фамилия Кошкарин почти не встречается в центральных русских регионах, зато хорошо известна в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области — как раз на территориях, где веками жили тюркские народы.

Обратите внимание на суффикс -ин, а не -ов. В русских фамилиях суффикс -ин присоединяется к основам на -а/-я (Кошкара → Кошкарин). Если бы фамилия произошла от прозвища Кошкарь (с мягким знаком), она скорее имела бы форму Кошкарев — по модели «звонарь → Звонарёв». Тот факт, что мы видим именно Кошкарин, подтверждает: исходное имя заканчивалось на «а», что типично для тюркских заимствований.

Среди носителей фамилии встречаются люди разных профессий, но исторически предки Кошкариных, скорее всего, были крестьянами или служилыми людьми из татарских или башкирских родов, принявших православие. В метрических книгах XIX века Кошкарины фиксируются в Казанской и Уфимской губерниях. Фамилия относительно редкая, и её география чётко указывает на волжско-уральские корни.