Основой фамилии Котращенко послужило мирское имя Котраш. Скорее всего, фамилия Котращенко образована от мирского имени Котраш, которое восходит к слову «котр». В некоторых говорах котром называли серп-траву, растение, которое шло на желтую краску. Согласно другой гипотезе, в основе этой фамилии лежит прозвище Котраш, связанное с названием реки Котра, которая протекала в Виленской и Гродненской губернии (правый приток Немана). Исток ее находился у озера Пеляса в Лидском уезде. Следовательно, Котрашем могли называть человека, жившего на берегу этой реки. Менее вероятной представляется этимологическая связь прозвища Котраш с диалектным глаголом «котренить», то есть «стряпать, готовить пищу». Так, Котрашем могли прозвать повара, кашевара. Чередование ш/щ характерно для украинской и белорусской ономастики. Суффикс –енко также указывает на украинское или белорусское происхождение фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Котраш, со временем получил фамилию Котращенко.