Основой фамилии Котяков послужило мирское имя Котяк. Личное имя Котяк, вероятно, представляет собой ласкательную форму имени Кот. Давая младенцу такое имя, как Котяк, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделена кошка. По другой версии фамилия Котяков образована от прозвища Котяк, которое восходит к аналогичному нарицательному. В некоторых диалектах котяком называют сухой помет домашней скотины. В старину котяк использовали в качестве удобрений или топлива. Прозвище Котяк мог получить крестьянин, торговавший котяком. Таким образом, потомок человека, обладающего именем или прозвищем Котяк, со временем получил фамилию Котяков.