Фамилия Ковырков — классический пример отчества, образованного от прозвища через суффикс -ов, который в центральной России указывал на принадлежность: «чей?» — Ковырков, то есть сын Ковырка. Само прозвище Ковырок происходит от глагола «ковырять», и здесь стоит разобраться подробнее, так как за одним корнем могут стоять совершенно разные занятия.

Первая и самая прямая версия — профессиональная. «Ковырять» значит делать углубление, рыть. Ковырком на Руси могли прозвать землекопа, пахаря или, например, человека, добывающего глину или руду. В этом случае фамилия указывает на тяжелый физический труд предка. Вторая версия — бытовая, связанная с мелкой, кропотливой работой: ковырять мог сапожник (шилом), резчик по дереву или даже портной. Третья версия — характерологическая: в некоторых говорах «ковыряться» означало действовать медленно, неторопливо, быть дотошным. В этом случае прозвище Ковырок закреплялось за человеком основательным и неспешным.

Словообразовательная модель здесь типична для северных и центральных регионов России: основа (Ковыр-) + суффикс -ок (уменьшительно-ласкательный, но в прозвищах часто выполнявший функцию «смягчения» грубого корня) + -ов (патронимический суффикс). Интересно, что фамилия Ковырков — не единственная в этом гнезде. Если бы прозвище звучало как Ковырь, мы бы получили Ковырев; если бы как Ковырка — Ковыркин. Вариант Ковырков говорит о том, что исходное прозвище было именно Ковырок, а не Ковыря.

В отличие от многих фамилий, образованных от церковных имен, Ковырков — «мирское» прозвище, данное по реальному качеству или занятию. Фамилия редкая, встречается очагово, что косвенно подтверждает её происхождение не от распространенного ремесла (как Кузнецов), а от местного говора или конкретной профессии, не имевшей массового характера.