Фамилия Козарина — редкий случай, когда фамильный суффикс -ин указывает не на принадлежность отцу, а на происхождение от матери. В русской традиции фамилии на -ин образовывались от основ на -а/-я: Пушкин, Ильин, Голицын. Но здесь основа Козарин — это не женское имя, а прозвище или профессия в мужском роде. Строго говоря, фамилия Козарина должна была бы звучать как Козаринов (сын Козарина), но в русском языке закрепилась форма с усечением, что встречается в южнорусских и украинских говорах. Такое явление — когда фамилия выглядит как матроним, но образована от мужского прозвища — и есть главная особенность этой фамилии.

Корень «козар» (или «козарин») восходит к этнониму «хазарин» — житель Хазарского каганата. В древнерусских летописях хазар называли «козаре», отсюда и форма Козарин. В XV–XVII веках прозвище Козарин давали либо человеку смуглой внешности, напоминавшей степняка, либо тому, кто торговал с хазарскими землями, либо просто выходцу с юга. Вторая версия — от слова «козарь», то есть пастух коз, но она менее вероятна: в русских говорах пастуха коз называли козопасом или козлятником, а «козарь» — это скорее украинское заимствование.

Географически фамилия Козарина встречается в основном на юге России — в Ростовской, Волгоградской областях, в Краснодарском крае, а также в Белгородской и Воронежской областях. Это зона, где исторически смешивались русское, украинское и тюркское население, и прозвище Козарин могло бытовать как у казаков, так и у крестьян. Сословно фамилия не была дворянской — её носили однодворцы, казаки и государственные крестьяне.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Козарев, Козаров, Козаренко — все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами. Козарина стоит особняком из-за нестандартного окончания, которое может вводить в заблуждение: человек с такой фамилией, скорее всего, потомок того самого Козарина, а не женщины Козарины.