Фамилия Кожукова — женская форма от Кожуков, а в её основе лежит прозвище или нецерковное имя Кожук. Слово «кожух» в древнерусском языке означало тулуп, полушубок из овчины, крытый сукном. Скорее всего, Кожуком называли человека, который носил такую одежду, шил её или торговал ею. В говорах слово имело и переносные значения: так могли прозвать медлительного, неповоротливого человека по ассоциации с тяжёлой зимней шубой, либо, наоборот, того, кто «кутается», любит тепло.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев присоединялся к основе, указывая на принадлежность — «сын Кожука» или «из семьи Кожуковых». Фамилия фиксируется в разных регионах, но особенно часто встречается в центральных и северных областях России, где овчинное ремесло было развито. В писцовых книгах XVI–XVII веков упоминаются крестьяне и посадские люди с этим прозвищем, например, в Новгородских и Тверских землях.

Интересно, что фамилия Кожуков нередко соседствует с однокоренными: Кожевников, Кожухарь, Кожухов. Но если Кожевников образован от ремесла выделки кожи, то Кожуков — от названия готового изделия, что указывает на более конкретную специализацию предка: он мог быть скорняком, портным-тулупником или просто владельцем характерной одежды. В некоторых диалектах «кожух» означал также верхнюю часть рукавицы или чехол для ружья, но это локальные варианты, не повлиявшие на основное значение фамилии.

Встречается и версия, связывающая фамилию с тюркским словом «кожук» — «щенок», но она маловероятна для русской фамилии: все известные ранние записи указывают на славянскую лексику, а тюркские заимствования в этом случае редки и не подтверждаются географией бытования. Так что основное, что можно сказать носительнице фамилии Кожукова: её предок, скорее всего, имел дело с овчиной или носил характерный тулуп, оставив след в прозвище, которое закрепилось за родом.