Фамилия Криштопина — довольно редкий случай в русском ономастиконе, и её разговор стоит начать не с корня, а с необычного суффикса. В отличие от стандартных русских фамилий на -ов/-ев или -ин, здесь мы видим окончание -а, которое указывает на женскую форму. То есть перед нами не исходная фамилия, а её вариант, принадлежащий женщине. Мужская форма — Криштопин.

Основа фамилии — личное имя Криштопа. Это белорусская народная форма канонического имени Кристоф, которое, в свою очередь, пришло из греческого языка (Χριστόφορος — «несущий Христа»). В эпоху Средневековья буквальное толкование этого имени породило легенду о Святом Кристофоре, могучем великане, который перенёс младенца Иисуса через бурную реку. Имя было популярно в католических и униатских регионах, поэтому фамилия Криштопин (и её женская форма) географически тяготеет к западным областям — к Беларуси, западной Брянщине, Смоленщине.

По словообразовательной модели это типичная «патронимическая» фамилия: суффикс -ин присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. Криштопа → сын Криштопы → Криштопин. Такая модель в прошлом была распространена в северных и центральных русских говорах, но в сочетании с западным именем даёт интересный гибрид: белорусское имя обработано русским суффиксом. Это говорит о том, что предок носителя фамилии жил на стыке культурных и языковых влияний.

Встречается и вариант написания через «е» — Крештопин, но он менее характерен. Фамилия не принадлежала к дворянским родам — в исторических документах Криштопины чаще всего значатся как крестьяне или мещане. Сословной истории по этой фамилии сохранилось немного, но сам факт её бытования в нескольких поколениях — уже свидетельство устойчивости прозвищного имени, которое не исчезло после отмены крепостного права.