Фамилия Крупейниковы (в мужском роде — Крупейников) образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «сын Крупейника». В основе лежит прозвище Крупейник. Вопреки распространённому мнению, связывающему эту основу со словом «крупный», более правдоподобна профессиональная версия. В южнорусских и украинских говорах «крупейник» — это не крупный человек, а торговец крупой или тот, кто занимается её обдиркой и изготовлением. Это слово встречается в документах XVII века, где «крупейниками» называли мельников, специализировавшихся на производстве гречневой и ячневой крупы. Прозвище могли дать и владельцу крупорушки — небольшой мельницы для крупы. Таким образом, фамилия Крупейниковы — это родовое именование по занятию предка-мельника или торговца. Географически фамилия тяготеет к областям бывшего Черноземья и Малороссии, где крупа была одним из основных продуктов питания. Встречается также вариант написания с одной «н» — Крупейников, что является орфографической нормой, а двойное «нн» в вопросе «Крупейниковы» — форма множественного числа, обозначающая весь род. О точном времени возникновения фамилии судить сложно: процесс закрепления прозвищ в качестве наследственных фамилий занял несколько столетий, но можно предположить, что основа фамилии сложилась не позднее XVII века, когда ремесленные прозвища активно переходили в фамилии. В отличие от многих «говорящих» фамилий, Крупейниковы не имеют однозначной связи с внешностью предка — их родовая история уходит в хозяйственный быт, в мир мельниц, закромов и торговли зерном.