Основой фамилии Крысь послужило церковное имя Хрисанф или Крискент. В её основе лежит имя Крыс (или Крысь) – производная форма одного из имён: Хрисанф (от греческого «златоцветный») или Крискент (от латинского «растущий»). К началу XX века имя Хрисанф вышло из широкого употребления, а имя Крыс подверглось переосмыслению по звуковому совпадению с хорошо знакомым словом «крыса». Менее правдоподобной кажется версия, согласно которой фамилия Крысь образована от прозвища Крыса. Крыса в народной традиции считается плохим животным, потому Крысем могли прозвать человека, не снискавшего уважения окружающих. Возможно, что Крысем прозвали того, что имел обыкновение «крыситься», то есть «злиться, гневаться, сердиться, не скрывая этого».