Фамилия Крысьев — редкий случай, когда основа прозвища настолько прозрачна, что сразу вызывает вопрос: за что человека могли назвать Крысой? Ответ, скорее всего, лежит не в прямом значении грызуна, а в переносном, бытовом. Прозвище Крыса в русских говорах давали не только тому, кто был мелок или вороват, но и человеку юркому, пронырливому, умеющему пролезть в любую щель. В некоторых диалектах «крыса» — ироничное прозвание прижимистого, скупого хозяина или, наоборот, того, кто постоянно роется, копается в мелочах.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на принадлежность. Крысьев — буквально «сын Крысы» или «человек из рода Крысы». Форма с -ев, а не с -ин (как было бы, если бы основа оканчивалась на -а), здесь объясняется тем, что в основе лежит не имя Крыса, а прозвище в форме существительного женского рода. В русской ономастике такие случаи не единичны: фамилии типа Свиньев, Лосев, Змеев образованы по тому же принципу, где суффикс -ев присоединяется к основе на мягкий согласный или к основе, которая в именительном падеже оканчивается на -я.

Географически фамилия редкая и встречается мозаично. По данным открытых источников, основная масса носителей сосредоточена в центральных и южных регионах России, с небольшими гнёздами в Ростовской области и на Украине. Это указывает на то, что фамилия могла возникнуть в среде крестьян или мещан, где прозвища были особенно цепкими и часто переходили в официальные фамилии при переписях XIX века.

Любопытно, что в старых писцовых книгах и ревизских сказках встречается форма Крысин, которая более логична с точки зрения грамматики (Крыса + -ин). Крысьев же — результат либо диалектного произношения (аканье или яканье), либо фиксации прозвища в другой падежной форме. Точных данных о дворянском происхождении этой фамилии нет — она выглядит как типичная «прозвищная» крестьянская, без привязки к знатным родам.

Если ваш предок носил фамилию Крысьев, он, скорее всего, был человеком с острым языком и заметной чертой характера, за которую его и прозвали. Никакого негативного оттенка в этом не больше, чем в фамилиях Волков или Лисов — прозвище просто закрепилось за родом.