Фамилия Крыжинский — типичный пример фамилии, образованной от географического названия по польско-украинской модели. Суффикс -ский указывает на дворянское или шляхетское происхождение в прошлом, хотя в Российской империи такие фамилии со временем распространились и среди духовенства, и среди крестьянства. Основа фамилии — топоним Крыжин (или Крыжино), а корень «крыж» — это польское и белорусское слово, означающее «крест».

Самая прямая версия: предок носителя фамилии происходил из населённого пункта с названием Крыжин (Крыжино, Крыжовка). Такие сёла встречаются на территории современной Беларуси, Украины и восточной Польши. Название деревни обычно связано с местным крестом (крыжом) — придорожным, поклонным или на перекрёстке дорог. Соответственно, Крыжинский — это «тот, кто из Крыжина».

Есть и менее очевидная, но возможная версия: прозвище Крыж мог получить человек, живший у креста, либо тот, кто носил на груди большой крест (например, монах или паломник). От этого прозвища сначала образовалось бы фамильное имя Крыжин (как вариант патронимической модели), а затем, при переходе в шляхетскую среду, к нему добавили типичный суффикс -ский. Так Крыжин стал Крыжинским.

В польской ономастике фамилия Krzysiński (через «ш») встречается чаще, но русское «ж» в написании «Крыжинский» выдает либо восточнославянскую адаптацию, либо происхождение из юго-западных губерний Российской империи (Волынь, Подолье, Гродненщина). Интересно, что в некоторых документах XIX века фамилию могли записывать через «ш» — Крышинский, что затем исправляли при сверке с метриками.

Социальный контекст: носители фамилии Крыжинский в основном относились к мелкопоместной шляхте или к духовному сословию. В списках выпускников духовных семинарий XIX века такие фамилии встречаются регулярно — семинаристы нередко получали фамилии при поступлении, и «Крыжинский» мог быть дан в честь праздника Воздвижения Креста Господня или по названию места рождения.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Крыжов, Крыжанский, Крыжановский — все они восходят к тому же «крыжу». Но Крыжинский стоит особняком: суффикс -ин- в основе указывает на более раннюю стадию образования, когда прозвище Крыжа превратилось в родовое имя Крыжины, и лишь затем оформилось в «панскую» форму на -ский.