Фамилия Ксендикова — редкий случай, когда основа с первого взгляда кажется иноязычной, но при ближайшем рассмотрении оказывается вполне славянской, хоть и с необычным звучанием. Разбирать её стоит не с корня, а с суффикса: -ов- указывает на типичную русскую модель образования от мужской фамилии Ксендиков. Женская форма Ксендикова — это буквально «жена или дочь Ксендика». Вопрос упирается в то, что такое «Ксендик».

Самая вероятная версия — это прозвище или имя Ксендик, образованное от греческого имени Ксенофонт (в обиходе — Ксеня). Уменьшительные суффиксы -ик или -ек в русских фамилиях часто давали формы вроде Ксендик, где «д» могло появиться для благозвучия (сравните: Сеня — Сендик, Ваня — Вандик). Таким образом, предок носительницы фамилии мог быть просто Ксеней, то есть человеком, носившим имя Ксенофонт, которое в переводе с греческого означает «чужой голос» или «чужеземный звук». Впрочем, это имя давали не чужеземцам, а обычным русским крестьянам и мещанам, особенно в южных и центральных губерниях, где греческие имена были распространены через церковные святцы.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с диалектным словом «ксендзь» (польский католический священник). В пограничных с Польшей и Литвой областях (Смоленщина, Брянщина, запад современной Беларуси) человека, служившего у ксендза или имевшего отношение к костёлу, могли прозвать Ксендик. Суффикс -ик в таком случае указывал бы на принадлежность: «сын ксендза» или «помощник ксендза». Однако эта версия слабее: фамилия Ксендикова встречается в основном в центральной России, а не в западных регионах, где форма «Ксендзов» или «Ксендзик» была бы логичнее.

Географически фамилия редкая, её очаги — преимущественно Ростовская область и Краснодарский край, что косвенно подтверждает версию с именем Ксенофонт: южнорусские говоры и казачья среда охотно сохраняли старые календарные имена в уменьшительной форме. Социальный срез — скорее всего, крестьянского или мещанского происхождения, без дворянских корней, так как фамилия не встречается в родословных книгах.

Итог: носительница фамилии Ксендикова может с высокой долей вероятности считать, что её предок по мужской линии носил уменьшительное имя Ксендик от Ксенофонта. Это имя, хоть и звучит экзотично, — обычный пример народной русской переработки церковного имени, где греческое звучание обросло славянскими суффиксами.