Фамилия Кубальский — типичный пример того, как одна буква в корне может запутать поиск происхождения. На слух она почти неотличима от «Купальский», но на письме разница принципиальна. Если бы фамилия писалась через «п», её логичнее всего было бы связывать с языческим праздником Ивана Купалы или с названием села Купала (такие есть в Беларуси и Польше). Но «б» в корне — не опечатка и не народная этимология, это отдельная линия.

Скорее всего, основа фамилии — прозвище или географическое название, связанное со словом «куб» или «кубель». В старых русских говорах «кубель» означало короб, лукошко, кадку, а в некоторых диалектах — плетёный улей или долблёную колоду для мёда. Человек по прозвищу Кубал (Кубаль) мог быть бондарем, делающим кадки, или бортником, добывающим дикий мёд. Менее вероятная, но возможная версия — от литовского «kubilas» (ушат, чан), что указывает на балтский след в фамилии: на землях бывшего Великого княжества Литовского (современные Беларусь, Литва, запад России) такие прозвища были обычны.

Суффикс «-ский» — классический признак шляхетской или дворянской фамилии в польско-литовской традиции, но в XIX веке он распространился и среди крестьян и мещан, особенно после того, как массово давались фамилии по названиям имений или деревень. Поэтому носитель фамилии Кубальский мог быть потомком мелкого шляхтича из местечка Кубалы (если такое существовало) или же его предок получил фамилию по прозвищу, просто «подогнав» её под модный тогда дворянский формат.

Встречаемость фамилии сегодня невысокая, она сосредоточена в западных областях России, в Беларуси и на востоке Польши. В некоторых польских источниках фамилию Kubalski связывают с гербом «Ястршембец» — это косвенно подтверждает её шляхетское происхождение у части носителей. Но без генеалогического исследования сказать, кем именно были предки конкретного Кубальского, невозможно: бортником, бондарем или обедневшим земянином.