Фамилия Кубаса — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее морфологии. В русском языке у неё нет продуктивного суффикса (как -ов или -ин), а окончание -а указывает на то, что перед нами, скорее всего, застывшая форма прозвища или имени, а не патроним. Основная версия — западнославянское происхождение, конкретнее, польское или белорусское. В польском языке «kubasa» — диалектное название колбасы (от литовского «kubasas» или напрямую из тюркских языков). Прозвище Кубаса могли дать мяснику, колбаснику или человеку с соответствующим телосложением. В белорусских говорах встречается слово «кубас» в значении «толстяк», что подтверждает прозвищную природу.

Менее вероятный, но возможный путь — от украинского «куб» (мера сыпучих тел) или от тюркского имени Кобаш (встречается у татар и башкир). Однако тюркская версия слабее: фамилия Кубаса почти не фиксируется в Поволжье и на Урале, зато встречается в западных областях России (Брянская, Смоленская) и на границе с Беларусью. Именно эта география — главный ключ. Если ваши предки носили фамилию Кубаса, с высокой вероятностью они происходили из крестьян или мещан западных губерний Российской империи, где фамилии на -а без суффикса — обычное дело (сравните: Сема, Губа, Коса).

Фамилия не имеет отношения к знаменитому кубинскому политическому деятелю Фиделю Кастро — это случайное созвучие, которое иногда вводит в заблуждение. В дореволюционных метрических книгах написание могло варьироваться: Кубаса, Кубасса, Кобаса. Двойное «с» обычно появлялось под влиянием польской орфографии.