Фамилия Кубасов образована от прозвища Кубас, и её происхождение напрямую связано с русским словом «кубас». В северных и поморских говорах так называли буй — якорный поплавок, а также неводной поплавок, чаще всего бочонок на ярусе (снасти для ловли рыбы). Поэтому логичнее всего предположить, что прозвище Кубас получил рыбак: человека могли прозвать по предмету его ремесла, как это часто бывало в промысловых сёлах.

Однако слово «кубас» звучало ёмко и метко, поэтому прозвище могло закрепиться и по другим причинам. В народной речи «кубасом» иногда дразнили полного, грузного человека (по ассоциации с надутым поплавком) или, напротив, неуравновешенного, «взрывного» — того, кто «вскипает», как поплавок на воде. Какая из версий верна для конкретного предка, теперь не установить, но обе имеют право на существование.

Исторические документы подтверждают древность этого прозвища. С. Б. Веселовский в своих ономастических работах приводит несколько ранних упоминаний: Кубас Мерлин (1551 год, Кашин), Кубас Константинович Мижуев (1565 год), а также Захарий Карпович Кубасов, погибший в 1578 году в бою под Кесью (нынешний Цесис в Латвии). В 1584 году упоминается Кубас Никитич Козлятев. Как видно, прозвище бытовало в разных слоях общества — от рядовых людей до служилых, что говорит о его широком распространении.

Сама фамилия построена по стандартной русской модели на -ов, то есть «сын Кубаса» или «из рода Кубаса». Несмотря на кажущуюся редкость, у фамилии есть очаги бытования: она встречается в старых переписях по Тверской, Ярославской и Вологодской губерниям, что совпадает с ареалом распространения промыслового слова «кубас». Так что, скорее всего, первые Кубасовы были либо рыбаками на Волге и северных реках, либо людьми, получившими яркое бытовое прозвище.