Фамилия Кученекова — женская форма фамилии Кученеков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев указывает на типичное русское происхождение: такие фамилии образовывали от личных имён, прозвищ или названий занятий отца. В основе лежит прозвище Кученек, которое, скорее всего, имеет уменьшительно-ласкательный оттенок.

Корень «куч-» отсылает к слову «куча» или глаголу «кучить» — в старых говорах это значило «собирать в кучу, сгребать, наваливать». Прозвище Кученек могли дать человеку невысокого роста, плотного сложения («круглый, как куча»), либо тому, кто работал с сыпучими материалами — зерном, углём, сеном. В некоторых диалектах «куча» означала ещё и «толпа, сборище», так что прозвище могло закрепиться за общительным или суетливым человеком.

Суффикс -енек в основе — редкий для фамилий. Обычно русские прозвища образуют с -ок/-ек (Кучок, Кучка), но форма Кученек встречается в южнорусских и западнорусских говорах. Она могла возникнуть из диалектного варианта «кучень» (небольшая куча) с добавлением уменьшительного -ек. Таким образом, Кученек — это «маленькая куча», и прозвище носило скорее шутливый или бытовой характер, без претензий на социальный статус.

Сословная принадлежность носителей фамилии не документирована широко. Судя по модели, Кученековы — потомки крестьян или посадских людей, а не дворянства. Фамилия не фиксируется в старых боярских списках и родословных книгах, что косвенно подтверждает её «низовое» происхождение. Географически фамилия тяготеет к центральным и южным областям России, хотя точных данных о распространении в XVII–XVIII веках нет.

В написании фамилии возможна вариативность: в старых метрических книгах могли писать «Кученикова» (от «кучень») или «Кученекова» с двойным «е» на стыке суффиксов. Однако современная орфография закрепила форму с одним «е» в корне. Однокоренные фамилии — Кучков, Кучкин, Кучеров — более частотны, но Кученекова стоит особняком из-за редкого суффиксального оформления, что делает её ценной для ономастов как пример диалектного словообразования.