Фамилия Кучугурина — женская форма, а мужская, Кучугурин, образована от прозвища или нецерковного имени Кучугура. Основа фамилии — диалектное слово «кучугура», которое в южнорусских и украинских говорах означает холм, бугор, насыпь, реже — копну или сугроб. Прямое значение прозвища — «холмистый», «бугристый», но в переносном смысле так могли назвать коренастого, плотного человека невысокого роста, похожего на кочку. Встречается и другая версия: связь с глаголом «кучугуриться» — хмуриться, сердиться, нахохлиться. Тогда Кучугура — человек с угрюмым, насупленным видом.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность «чей?» — сын Кучугуры, то есть Кучугурин. В украинской среде та же основа могла дать фамилию Кучугуренко, в польской — Kuczugura. При этом суффикс -ин — один из древнейших в восточнославянской антропонимии, он закрепился в северных и центральных областях России. Поэтому географически фамилия Кучугурины чаще встречается в Поволжье, на Средней и Нижней Волге, а также в некоторых районах Черноземья — там, где слово «кучугура» было в ходу.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к украинскому топониму Кучугуры (село в Харьковской области) — скорее наоборот, и село, и фамилия восходят к одному диалектному корню. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель на -ин от прозвищ, описывающих внешность, названа одной из самых продуктивных, но Кучугурин среди примеров не приводится — фамилия довольно редкая. Встречается вариант с ударением на второй слог: Кучу́гура, что ближе к украинскому произношению, и на третий: Кучугу́ра, что типично для русского языкового чутья.

Сословная принадлежность носителей фамилии не прослеживается: Кучугурины могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками. В документах XVII–XVIII веков фамилия фиксируется в разрядных книгах и ревизских сказках южных уездов, но массового распространения не получила. Сегодня фамилия остаётся относительно малочисленной, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска — круг предков сужается до конкретных регионов.