Фамилия Кукоров образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ов. Этот суффикс присоединяли к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный, и означал он принадлежность: «чей?» — Кукоров, то есть «сын (или потомок) Кукора». Такие именования широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян.

Основа фамилии — Кукор. Это древнерусское нецерковное имя или прозвище. Славянские фамилии возникали от личного прозвища или от имени (христианского или языческого), и здесь мы имеем дело с языческим, мирским именем. В словарях древнерусских личных имён (например, у С. Б. Веселовского) встречается имя Кукор, а также его варианты — Кукора, Кукорка. Прямое значение слова «кукор» в русских говорах — «коротышка», «недоросток», «заморыш». Прозвище давали человеку невысокого роста или щуплому, слабому телосложению.

Версия о происхождении от ремесла или профессии менее правдоподобна. Хотя в некоторых диалектах «кукор» могло означать вид лодки или снасти, для прозвища человека такое значение маловероятно — скорее всего, это была бы фамилия Кукорёв (от названия лодки «кукора»), а не Кукоров.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России. В старых писцовых книгах по Новгородской и Вологодской землям (XVI–XVII века) встречаются крестьяне и посадские люди с именем Кукор или прозвищем Кукор. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, крестьянами или ремесленниками, а не дворянами.

Интересная деталь: ударение в фамилии может падать как на первый, так и на последний слог — Ку́коров и Кукоро́в. Второй вариант (с ударением на окончание) встречается реже и может указывать на украинское или белорусское происхождение, где суффикс -ов под ударением — обычное дело. В русской традиции нормативным считается ударение на первый слог: Ку́коров.