Фамилия Кукурдаева — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а звукоподражательное прозвище, скорее всего, связанное с птицей. Корень «кукур» явно восходит к глаголу «куковать» или к самому крику кукушки: в русских говорах слово «кукурда» или «кукурдак» могло означать либо кукушку, либо несуразного, нескладного человека — того, кого в народе называли «кукушкой» за нелюдимость или странное поведение. В ономастике это объяснимо: прозвища по крику птиц (кулик, ворона, кукушка) давали людям с характерным голосом, привычкой повторять одно и то же или с внешним сходством (например, сутулая фигура, напоминающая нахохлившуюся кукушку).

Модель образования фамилии — типичная для русского Северо-Запада и Поволжья: основа на твердый согласный (Кукурд-) плюс суффикс -аев. В отличие от стандартного -ов, форма Кукурдаев встречается реже и указывает на вариант, закрепившийся в местных говорах, где ударение падало на конечный слог. Если бы фамилия происходила от имени Кукурда (гипотетического, неканонического), то она писалась бы как Кукурдин или Кукурдов. А вот суффикс -аев характерен для фамилий, образованных от прозвищ на -ай, -ей, -уй: ср. Бородаев, Глазаев, Кукураев. То есть исходное прозвище могло звучать как Кукурдай — человек, который «кукует», то есть постоянно ворчит, жалуется или, наоборот, одинок, как кукушка.

Географически фамилия Кукурдаева тяготеет к северным и центральным областям России: по данным открытых источников, большинство носителей зафиксированы в Кировской, Нижегородской и Костромской областях. Это косвенно подтверждает версию о диалектном происхождении — именно в севернорусских говорах слово «кукурда» бытовало в значении «кукушка» или «нескладный человек». В Словаре русских народных говоров есть форма «кукурда» — «неуклюжий, нерасторопный человек», что делает прозвище не оскорбительным, а скорее бытовым, описательным.

Таким образом, предок носителя фамилии Кукурдаев получил прозвище, скорее всего, за манеру поведения или внешность, напоминавшие кукушку. Со временем прозвище закрепилось за родом, а суффикс -аев оформил его в фамилию, сохранившуюся в северных русских землях. Другие версии (например, связь с тюркским «кукур» — «сухой, хилый») менее вероятны, так как фамилия не имеет характерных для тюркских заимствований окончаний и распространена в исконно русских регионах.