Фамилия Култышев образована по стандартной для русского севера и востока модели: от прозвища или имени Култыш с помощью патронимического суффикса -ев. Основа здесь — «культя», то есть рука или нога без пальцев, либо культяпка. Прямое значение ясное: прозвище Култыш мог получить человек с физическим недостатком — хромой или безрукий. Такие прозвища на Руси давали без злого умысла, по внешнему признаку, и они легко закреплялись за родом.

Но есть и менее очевидная версия. В северных и сибирских говорах слово «култышки» означало «дурная стряпня» — невкусная, неумело приготовленная еда. Соответственно, Култышем могли в насмешку назвать плохого повара, который портил продукты. Оба варианта имеют право на существование, и определить, какой из них сработал в конкретной семье, уже невозможно.

Обратите внимание на суффикс -ыш, который в русских прозвищах часто придаёт оттенок уменьшительности или пренебрежения: Култыш — это не просто «культя», а «короткая, неполноценная конечность». Такая словообразовательная модель характерна для имён-прозвищ, которые потом переходили в фамилии без изменений.

Фамилия Култышев встречается в основном в Прикамье, на Урале и в Западной Сибири — то есть в регионах, куда шла активная колонизация из северных и центральных русских земель. Это косвенно подтверждает, что прозвище было распространено среди крестьян и посадских людей, а не в дворянской среде. Никаких сведений о знатных родах Култышевых нет — фамилия осталась в простонародной среде.