Фамилия Култышов — редкий пример, где основа, скорее всего, связана не с именем или профессией, а с физической особенностью или диалектным словом. В её центре — корень «култыш», который в русских говорах имел два основных значения. Первое и самое вероятное: «култыш» — это культя, то есть человек без руки или без ноги, либо с искалеченной конечностью. Прозвище Култыш могли дать хромому, безрукому или тому, кто ходил с заметной хромотой. Второе, менее распространённое значение — «култыш» в некоторых областях называли короткий обрубок, огрызок или даже небольшой кусок хлеба, но для прозвища человека это значение маловероятно.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Култышов — «сын Култыша» или «из рода Култыша». Фамилия образована от прозвища, а не от крестильного имени, что типично для «дефектных» прозвищ: на Руси такие особенности внешности или здоровья часто становились основой для фамилий, не неся в себе оскорбительного оттенка — это было просто опознавательным знаком. В документах фамилия могла писаться и через «а» — Култашов, но исходная форма с «ы» более устойчива.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку европейской России. По данным переписей и современных справочников, Култышовы чаще всего встречаются в Пермском крае, Кировской области и Удмуртии. Это регионы, где активно бытовали архаичные прозвищные фамилии, и где в говорах слово «култыш» сохранялось дольше всего. В сословном отношении это почти наверняка крестьянская фамилия: в списках дворянских родов она не значится, а в ревизских сказках XIX века Култышовы числятся среди государственных или помещичьих крестьян.

Интересно, что фамилия не имеет однозначного тюркского или финно-угорского следа, хотя живёт на территории, где такие влияния сильны. Корень «култ-» не даёт прямых параллелей с татарскими или марийскими антропонимами, поэтому версия с чисто русским диалектным прозвищем остаётся основной. Встречаются однокоренные фамилии — Култыгин, Култышев — но Култышов стоит особняком из-за редкого суффиксального оформления: «-ыш» здесь не столько уменьшительное, сколько указание на предмет или лицо с характерным признаком, как в словах «глупыш», «коротыш».