Фамилия Кундобин встречается довольно редко, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Кундобин явно восходит к прозвищу. В основе лежит слово «кундоба» или «кундобый», которое в северных и сибирских говорах имело значение «неповоротливый, неуклюжий, мешковатый человек». Есть и другое, более конкретное значение — так могли назвать человека с грубой, неладной походкой. Прозвище, скорее всего, давали не в насмешку, а как бытовую характеристику, которая постепенно закрепилась за родом.

Суффикс -ин указывает на принадлежность. В древнерусской модели это означало «чей?» — «сын Кундобы». Такая форма типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а или -я. То есть первоначально Кундобин — это «сын Кундобы», а со временем фамилия потеряла отсылку к отцу и стала родовой.

Интересна география фамилии. Кундобины традиционно фиксируются в Вологодской, Архангельской областях и в Сибири, куда переселенцы из Поморья принесли свой говор и прозвища. Это наводит на мысль, что корни фамилии — именно в севернорусском наречии. В центральных и южных областях России она почти не встречается, что делает её хорошим маркером регионального происхождения предков.

Слово «кундоба» созвучно с тюркскими корнями (например, «кун» — день, солнце), но для фамилии Кундобин тюркская версия маловероятна. Во-первых, значение не складывается в осмысленное прозвище. Во-вторых, суффикс -ин и ареал бытования тянут к славянской диалектной основе. Поэтому версия с северорусским прозвищем «кундоба» — самая правдоподобная.

В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян Кундобиных в Тотемском уезде Вологодской губернии. Сословно фамилия почти наверняка крестьянская, без дворянских корней. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано, что только подтверждает её простонародное происхождение.