Фамилия Кунтышева — женская форма фамилии Кунтышев, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. Основа «Кунтыш» звучит не по-русски, и это ключ к происхождению. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского корня, распространённая в Поволжье и на Урале, среди народов, исторически контактировавших с русскими.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — Кунтышев). Но исходное прозвище или имя Кунтыш требует расшифровки. Самая правдоподобная версия связывает его с татарским или башкирским словом «кунтыш» (или «кундыш»), которое в диалектах означает «бобр» или «выдра». Прозвище могли дать охотнику, добытчику пушнины, либо человеку, напоминавшему этого зверя повадками или внешностью — например, приземистому или коренастому.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза: от мужского имени Кунтыш, которое могло быть вариантом имени Кунтуган (от тюркского «кун» — солнце, день). В этом случае фамилия перешла в разряд патронимических, то есть образованных от личного имени предка. В пользу тюркского происхождения говорит и география: фамилия Кунтышевы встречается в Челябинской области, Башкортостане, Татарстане — в зоне активного смешения русского и тюркского населения.

Примечательно, что фамилия сохранила редкий для русского уха корень, который не переосмыслили в более привычные «Кузьмин» или «Кутузов». Это указывает на относительно позднее закрепление фамилии (XVII–XIX века), когда прозвища фиксировались уже в письменных источниках без адаптации. Среди однокоренных фамилий — Кундышев, Кунтышев (с окончанием на -ев у мужчин), что подтверждает вариантность написания в старых метриках.

Сословная принадлежность первых носителей не установлена, но чаще такие фамилии носили государственные крестьяне или казаки — люди, чьи прозвища отражали не знатное происхождение, а бытовые реалии. Таким образом, Кунтышева — это фамилия, которая ведет к конкретному человеку, вероятно, жившему на южном Урале и получившему прозвище от местного зверя или тюркского имени.