Фамилия Куповой — женская форма, но её основа мужская: Куповой. Такая модель образования (Купов + окончание -ой) встречается реже, чем стандартные -ов/-ев, и указывает на прилагательное в именительном падеже, которое закрепилось как фамилия. В русской ономастике фамилии на -ой обычно происходят от прозвищ или прилагательных, отвечающих на вопрос «какой?»: Толстой, Глухой, Куповой.

Корень «куп» многозначен. Самое прямое объяснение — от слова «купа» в значении «груда, куча, стог» или «группа предметов». В южных и западных говорах «купа» означала стог сена или соломы, а «куповой» — относящийся к купе, стоговой. Предок мог быть крестьянином, который занимался сенокосом, или владельцем большого стога — прозвище давали по хозяйственной примете. В. И. Даль фиксирует и глагол «купить» в значении «копить, собирать», но в фамилии вероятнее именная основа.

Есть версия, что фамилия связана с купечеством: «купа» в древнерусском — «торг, совместная покупка», отсюда «купец». Но суффикс -ов-ой скорее указывает на притяжательность от прозвища, чем на сословную принадлежность. Если бы предок был купцом, фамилия чаще звучала бы как Купцов или Купецкий.

Встречаются однокоренные фамилии: Купов, Купа, Купцов. Куповой — редкая форма, которая могла закрепиться в южнорусских регионах или в казачьей среде, где фамилии на -ой были обычны (Кривой, Белой). Точной географической привязки нет, но такие фамилии чаще фиксируются в бывших южных губерниях: Курской, Воронежской, Ростовской областях.

Таким образом, носитель фамилии Куповой в мужском роде — потомок человека, которого прозвали Куповым за связь со стогом сена, реже — за участие в складчине или торге. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, без сложной генеалогии.