Фамилия Купрещенко — характерный пример украинской модели фамилии на -енко, самой распространённой на Левобережной и Степной Украине. Суффикс -енко изначально означал «маленький», «сын» или «ученик», то есть Купрещенко — это «сын Купреща». Но кто такой Купрещ?

Основа фамилии — имя Купрей или Куприй, народная форма канонического имени Куприян (от латинского Cyprianus — «кипрский», по названию острова Кипр). В украинской традиции имя Куприй давали мальчикам, родившимся в день святого Киприана (Куприяна). Форма Купрещ возникла путём типичного для украинской фонетики чередования: в некоторых говорах «и» после губных переходило в «е», а конечное -ий могло редуцироваться до -щ. Так из Куприй получилось Купрещ, а от него — Купрещенко.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Купрей от слова «купри» (кудри, вьющиеся волосы). В этом случае Купрещенко — потомок кудрявого человека. Однако имя-основа выглядит убедительнее, потому что прозвища редко образовывали патронимы с таким суффиксом в украинской среде.

Фамилия Купрещенко почти не встречается за пределами Украины и юга России. В XIX веке её носители — преимущественно крестьяне и казаки Черниговской, Полтавской и Харьковской губерний. Сословная принадлежность была однородной: мещане и государственные крестьяне, без дворянских ветвей. Это типичная «народная» фамилия, которая не попала в родословные книги, но сохранилась в метрических записях и ревизских сказках.

В написании возможны варианты: Купрещенко, реже Купрещенко (с ударением на предпоследний слог). В русской среде фамилию иногда переделывали в Купрещенков, добавляя русский суффикс -ов, но такая форма осталась единичной. Сегодня Купрещенко — редкая фамилия, носители которой живут в основном в Украине и в диаспоре.