Фамилия Купрещенков — яркий пример того, как редкий суффикс искажает привычную картину. Большинство русских фамилий на -ов/-ев образованы от притяжательных прилагательных: «чей?» — Иванов, Петров. Здесь же мы видим суффикс -енк- (уменьшительный, как в «котёнок»), который в фамилиях обычно закрепляется в украинской модели на -енко: Купрещенко. А вот окончание -ов — уже чисто русское, «обрусевшее» добавление. То есть перед нами гибрид: исходная фамилия звучала как Купрещенко (от прозвища или отчества), а при переходе в великорусскую среду её «подогнали» под местный стандарт, нарастив -ов. Такое нередко случалось на южных рубежах России, в казачьих областях или среди переселенцев.

Основа фамилии — Купрещ(а). Это народная, разговорная форма крестильного имени Куприян (церковное Киприан). В русских говорах имя легко сокращали и переделывали: Купря, Купрей, Купреша. Купреща — ласкательное, почти «Куприк». Суффикс -енк- указывает на «маленького Купрещу»: сына, потомка. Так что исходное значение — «сын Купрещи», то есть внук или правнук человека по прозвищу Купреща.

В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) подобные формы с двойным суффиксом разбираются как свидетельство многоступенчатого образования. Сначала появилось прозвище Купреща (от Куприян), затем от него — фамилия Купрещенко (в украинской или южнорусской традиции), а позже, при адаптации в северных или центральных губерниях, к ней приросло -ов. Фамилия редкая, в переписях XIX века встречается в основном в Курской, Воронежской и Харьковской губерниях — как раз в зоне смешения украинского и русского населения.

Носители Купрещенковы, скорее всего, происходят из крестьян или однодворцев (государственных крестьян южных окраин). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Примечательно, что однокоренные Купреев, Куприков, Купреенко — все восходят к тому же имени Киприан, но Купрещенков стоит особняком из-за редкостного суффиксального стечения.