Фамилия Купряшкин образована от имени Купряшка — народной, обиходной формы крестильного имени Киприан. В латинском языке это имя (Cyprianus) означало «кипрский», то есть уроженец острова Кипр, и пришло на Русь вместе с христианством. В просторечии имя Киприан превратилось в Куприян, а ласковая или уменьшительная форма стала звучать как Купря, Купряша или Купряшка. Именно от этой последней формы — Купряшка — и пошла фамилия.

Суффикс -ин в фамилии Купряшкин указывает на принадлежность: «чей?» — купряшкин, то есть сын или потомок Купряшки. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а/-я: Купряшка → Купряшкин. Исходное имя Купряшка в старину могло быть как самостоятельным именем, так и прозвищем, закрепившимся за человеком в быту.

Поскольку в основе лежит каноническое имя Киприан, фамилия Купряшкин относится к группе «полуотчеств» — фамилий на -ин, образованных от разговорных вариантов крестильных имён. Родственные фамилии — Куприянов, Куприн, Купряков, Купренков. Все они восходят к одному имени, но через разные суффиксы и формы: Куприянов — от полной формы Куприян, Куприн — от краткой Купря, а Купряшкин — от уменьшительной Купряшка.

Географически фамилия Купряшкин встречается в центральных и южных регионах России, а также в Поволжье, что типично для фамилий, образованных от народных форм имён. В документах XVIII–XIX веков носители фамилии числились в основном среди крестьян и мещан — сословий, где именные прозвища и уменьшительные формы были особенно распространены. Потомок человека по имени Купряшка со временем и получил фамилию Купряшкин.