Фамилия Курнаткина — женская форма фамилии Курнаткин. Её основа — слово «курнатый» или «курнатка». В русских говорах так называли человека с коротким, обрубленным носом или вообще безносого. Сравните: «курносый» — того же корня, с чередованием согласных. Прозвище Курнатый или Курнатка давали по характерной внешности, и от него пошла фамилия.

Модель образования простая: суффикс -ин указывает на принадлежность. Курнаткин — буквально «сын Курнатки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён на -а, -я. Суффикс -к- в основе — уменьшительный или пренебрежительный, то есть Курнатка — это «коротконосый» в бытовом, неофициальном варианте.

Географически фамилия Курнаткин встречается в центральных и южных регионах России, особенно в бывших Курской, Тамбовской и Воронежской губерниях. Именно там диалектное слово «курнатый» было в ходу. Встречаются и варианты написания: Курнатов, Курнаев, но Курнаткин — самый частый.

Версия о связи с тюркским «курнак» (жертвоприношение) или «курнат» (строить) маловероятна: фамилия явно славянская по словообразованию, а её основа прозрачна для русского уха. Никаких документальных подтверждений тюркского корня нет.

Сословно Курнаткины, скорее всего, крестьяне или однодворцы. Фамилия не аристократическая, без дворянских приставок, и её носители в XIX веке числились в основном в крестьянских ревизских сказках. Ничего выдающегося — обычная русская фамилия по внешнему признаку, каких тысячи.