Фамилия Курнукин образована от прозвища Курнука. Оно, предположительно, берет начало от глагола «курныкать» со значением «мурлыкать, петь про себя, в полголоса». Вероятно, именование Курнука отражает привычки его обладателя. Так могли назвать того, кто любил напевать сам себе для настроения. Кроме того, глагол «курныкать» имеет значение «стоять на одной ноге». Можно предположить, что прозвище Курнука принадлежало тому, у которого была одна нога, или тому, кто опирался на одну ногу, когда стоял. Так и прозвище Курнука закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Курнукин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Курнука, со временем получил фамилию Курнукин.